通过阿里云服务器助力研究生的mRNA疫苗课题进展

简介: 在mRNA疫苗的构建中,最重要的就是前期的序列设计,通过更换5’UTR和3’UTR以及CDS的优化来提高mRNA序列的稳定性从而提高mRNA的产量,现在比较常用的是Ribotree的使用,但是需要用Linux操作系统以及Python语言的使用,但是由于学生经济的限制,故通过简单又高效的云服务器来完成环境的搭建以及程序的运行,极大地降低了操作难度,为本人的课题保驾护航。

我是一名研究生一年级的同学,就读的专业是病原生物学,目前正在做的课题是某种病毒mRNA疫苗的构建,因为在课题的前期要对mRNA序列进行设计和优化,而目前国内相应的技术尚不成熟,在使用了Ribotree来优化序列的时候有需要Linux系统和Python语言,但是由于只有一台电脑,而虚拟机的使用又有一些困难,故在朋友的建议和知乎文章相关介绍中,接触到了阿里云服务器和飞天加速计划·高校学生在家实践计划,这对我来说确实是全新的领域,我从实例的概念开始一点点入手,逐渐的熟悉了相关的操作。
在连接云服务器的过程中,因为我要上传我相关的文件才能输出我的结果,所以在朋友的建议下,使用了SSH连接工具,从而输入我的文件。在最开始通过新手教程搭建LAMP时,跟着网页自带的教程一步步操作,到了某一步的时候,输入代码显示有问题,随后直接用镜像搭建了环境;还有一次操作中因为云服务器在运行,所以我用SSH工具连接的时候,显示连接成功但是界面没有跳转,后面将云服务器强行停止再启动,就可以正常登陆。
对于我来说云服务器是个全新的东西,在接触到之后感觉到有一个新的领域自己之前从来不知道,颇有井底之蛙的味道,第一次运行程序,第一次输出结果,都让我很新奇,再次的让我意识到学习的重要性,计算机的发展日新月异,要不断的学习才能和时代接轨。这次的mRNA序列优化算是一个契机,让我接触到了“云”的概念,之后我也要积极尝试,去做个自己的网页或者博客,继续去探索阿里云的无限奥秘,在“云”世界不断的遨游。

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