Python时间序列分析工具Aeon使用指南

简介: **Aeon** 是一个遵循 scikit-learn API 风格的开源 Python 库,专注于时间序列处理。它提供了分类、回归、聚类、预测建模和数据预处理等功能模块,支持多种算法和自定义距离度量。Aeon 活跃开发并持续更新至2024年,与 pandas 1.4.0 版本兼容,内置可视化工具,适合数据探索和基础分析任务。尽管在高级功能和性能优化方面有提升空间,但其简洁的 API 和完整的基础功能使其成为时间序列分析的有效工具。

Aeon 是一个专注于时间序列处理的开源Python库,其设计理念遵循scikit-learn的API风格,为数据科学家和研究人员提供了一套完整的时间序列分析工具。该项目保持活跃开发,截至2024年仍持续更新。

Aeon提供了以下主要功能模块:

  1. 时间序列分类- 支持多种分类算法实现- 包含基于间隔、字典和距离的分类器- 提供集成学习方法
  2. 时间序列回归分析- 支持各类回归模型- 提供预测区间估计- 包含模型评估工具
  3. 时间序列聚类- 实现了多种聚类算法- 支持自定义距离度量- 提供聚类结果可视化
  4. 预测建模- 包含多种预测模型实现- 支持单变量和多变量预测- 提供预测性能评估工具
  5. 数据转换与预处理- 提供多种数据转换方法- 支持时间序列特征提取- 包含数据标准化工具

技术特点

  1. API设计- 采用scikit-learn风格的API设计- 提供统一的fit/predict接口- 支持管道(Pipeline)操作
  2. 可视化支持- 内置多种可视化工具- 支持时间序列数据探索- 提供聚类和分类结果展示
  3. 数据兼容性- 与pandas数据结构深度集成- 支持多种数据格式输入- 需注意与pandas版本的兼容性要求

技术兼容性说明:经验证,Aeon目前仅与Pandas 1.4.0版本完全兼容。由于Pandas新版本对索引API进行了重构,可能导致与部分时间序列处理功能产生兼容性问题。

虽然在可视化方面提供了良好的基础功能,但相比Matplotlib等专业可视化库,其灵活性仍有一定限制。以下将通过具体示例,展示Aeon在各个功能模块的实际应用。

Aeon时间序列可视化功能分析

Aeon提供了一套用于探索性数据分析的可视化工具集。以下将展示其基础线图绘制功能。

 """
 Aeon时间序列可视化示例
 演示Aeon内置的探索性数据分析可视化工具
 基础线图绘制
 """
 from aeon.datasets import load_airline
 from aeon.visualisation  import plot_series
 %matplotlib inline
 # 航空客运量数据集
 y = load_airline()
 plot_series(y, title="Airline Passenger Numbers")

从效果来看,虽然没有特别出众的特点,但绘图结果清晰实用。

时间序列聚类与分类技术实现

在实际应用中,部分时间序列数据遵循特定的模式规律,但对这些序列的模式归类往往具有一定难度。面对随机信号时,如何将其与具有相似特征的信号进行准确分类就成为一个关键问题。

在这种场景下,聚类算法可以提供有效的解决方案。以下示例代码将生成50个随机样本,这些样本分别遵循三种基本模式(正弦函数、余弦函数或2倍频率的正弦函数)。通过Aeon我们可以利用k最近邻算法对这些样本进行模式分类。这种方法能够有效地将不同序列划分到相应的类别中,便于后续对特定类别进行深入分析。若不进行聚类处理,这些序列叠加在一起会呈现出噪声状态,不利于进一步分析。

 """
 时间序列聚类实现
 基于K-means算法的时间序列分组示例
 """
 importnumpyasnp
 importmatplotlib.pyplotasplt
 fromaeon.clusteringimportTimeSeriesKMeans
 defmake_example_dataset(n_samples=50, n_timepoints=30, random_state=42):
     np.random.seed(random_state)

 # Generate three different patterns
 t=np.linspace(0, 2*np.pi, n_timepoints)
 patterns= [
     lambda: np.sin(t),
     lambda: np.cos(t),
     lambda: 0.5*np.sin(2*t)
 ]

 X= []
 for_inrange(n_samples):
     # Randomly choose a pattern function
     pattern_func=np.random.choice(patterns)
     # Generate the pattern and add some noise
     series=pattern_func() +np.random.normal(0, 0.1, n_timepoints)
     X.append(series)

 returnnp.array(X)

相比前述航空客运量数据集的线图,这组聚类可视化结果展现出更为优秀的图形效果。

利用已获得的类别标签,我们可以进一步通过Aeon的分类器进行数据分类。由于使用的是模拟数据集,算法呈现出的完美分类效果在预期之内。

 from aeon.classification.interval_based import TimeSeriesForestClassifier
 from sklearn.model_selection import train_test_split
 # Split into train and test sets
 X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, labels, test_size=0.2, random_state=42)
 # Initialize and train a classifier
 clf = TimeSeriesForestClassifier(random_state=42)
 clf.fit(X_train, y_train)
 # Make predictions
 y_pred = clf.predict(X_test)
 # Calculate accuracy
 accuracy = np.mean(y_pred == y_test)
 print(f"Accuracy: {accuracy:.2f}")
 # Print some information about the data
 print(f"\nData shape: {X.shape}")
 print(f"Number of classes: {len(np.unique(labels))}")
 print(f"Class distribution: {np.bincount(labels)}")

实验结果

 Accuracy: 1.00  

 Data shape: (50, 30)  
 Number of classes: 3  
 Class distribution: [13 21 16]

需要说明的是,尽管Aeon文档中提到了'ETSForecaster'功能模块,但在实际测试中未能成功运行该模块。

总结

Aeon作为一个时间序列分析工具,在基础功能实现和易用性方面表现良好,特别适合用于数据探索和基础分析任务。虽然在某些高级功能和性能优化方面还有提升空间,但其简洁的API设计和完整的基础功能仍使其成为时间序列分析的有效工具选项。建议根据具体项目需求,合理评估其适用性,必要时可与其他专业工具配合使用,以获得最佳的分析效果。

https://avoid.overfit.cn/post/962958df56f64b06b20befb72d74bef8

作者:Kyle Jones

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