import torch from torch import nn import dgl from dgl.nn.pytorch import RelGraphConv # 定义图结构 edges = torch.tensor([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) edges_src = torch.tensor([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) edges_dst = torch.tensor([1, 2, 3, 0, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) rel_type = torch.tensor([0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 3]) graph = (edges_src, edges_dst) # 将元组图结构转换为DGLGraph对象 g = dgl.graph(graph) # 定义模型 class RGCN(nn.Module): def __init__(self, in_feats, hid_feats, out_feats, rel_num): super(RGCN, self).__init__() self.conv1 = RelGraphConv(in_feats, hid_feats, rel_num) self.conv2 = RelGraphConv(hid_feats, out_feats, rel_num) def forward(self, g, feats, rel_type): h = self.conv1(g, feats, rel_type) h = torch.relu(h) h = self.conv2(g, h, rel_type) return h # 创建模型 in_feats = 3 hid_feats = 4 out_feats = 2 rel_num = 4 model = RGCN(in_feats, hid_feats, out_feats, rel_num) # 随机生成特征 features = torch.randn((10, 3)) # 计算输出 output = model(g, features, rel_type) print(output)
上面的代码主要是实现了一个基于关系图卷积网络(RGCN)的模型。
代码实现的详细解释如下:
- 首先,使用 PyTorch 定义了一个 RGCN 模型,并通过构造函数中的
in_feats
,hid_feats
,out_feats
和rel_num
来指定输入特征维度,隐藏层维度,输出特征维度和关系类型数量。
class RGCN(nn.Module): def __init__(self, in_feats, hid_feats, out_feats, rel_num): super(RGCN, self).__init__() self.conv1 = RelGraphConv(in_feats, hid_feats, rel_num) self.conv2 = RelGraphConv(hid_feats, out_feats, rel_num)
- 在模型的前向传递函数中,将输入特征
feats
和关系类型rel_type
通过RelGraphConv
进行关系图卷积,同时使用 ReLU 激活函数对隐藏层的特征进行非线性变换。
def forward(self, g, feats, rel_type): h = self.conv1(g, feats, rel_type) h = torch.relu(h) h = self.conv2(g, h, rel_type) return h
- 接着,使用 PyTorch 创建了一个大小为 10x3 的张量
features
作为输入特征。
features = torch.randn((10, 3))
- 将定义好的元组图结构
graph
转换为 DGLGraph 对象g
。
g = dgl.graph(graph)
- 最后,将
g
,features
和rel_type
作为输入,通过调用模型的前向传递函数forward
计算输出特征output
,并将其打印出来。
output = model(g, features, rel_type) print(output)
在计算输出时,模型会将输入的元组图结构 graph
转换为 DGLGraph 对象 g
。g
的结构与 graph
是相同的,但是由于它是 DGLGraph 对象,因此可以使用 DGL 提供的一系列 API 来进行图的操作和计算,例如采样、聚合和传播等。在 RGCN 中,DGL 提供的关系图卷积层(RelGraphConv
)用于实现图卷积计算。
----------------介绍整个代码实现了什么功能?
这段代码实现了一个基于关系图卷积神经网络(R-GCN)的节点分类任务,具体实现过程如下:
- 定义图结构:使用 PyTorch 张量定义了一张包含 10 条边的有向图,并指定每条边的起点、终点和关系类型。
- 将元组图结构转换为 DGLGraph 对象:使用 DGL 库提供的函数将元组图结构转换为 DGLGraph 对象,以便后续在其上运行图卷积神经网络。
- 定义 R-GCN 模型:使用 PyTorch 搭建了一个包含两个 R-GCN 层的模型,每个层都使用了相同的关系类型数,并指定了输入特征维度、隐藏层维度和输出特征维度。
- 随机生成特征:使用 PyTorch 生成了一个形状为 (10, 3) 的张量作为节点特征。
- 计算输出:将定义好的模型、DGLGraph 对象和节点特征输入模型,计算输出。输出的形状为 (10, 2),即 10 个节点对应的分类概率。最后将输出打印出来。
解释下面的含义:
edges = torch.tensor([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) edges_src = torch.tensor([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) edges_dst = torch.tensor([1, 2, 3, 0, 4, 5, 6, 7, 8, 9]) rel_type = torch.tensor([0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 3])
这里定义了一个有向图,其中图中包含10个节点,通过分别指定edges_src和edges_dst中的源节点和目标节点来定义每条边。rel_type是用来指定每个边的关系类型,共有4种类型,分别用0、1、2、3表示。具体来说,这里定义了以下10条有向边:
- 0 -> 1 (关系类型为0)
- 1 -> 2 (关系类型为0)
- 2 -> 3 (关系类型为0)
- 3 -> 0 (关系类型为1)
- 4 -> 1 (关系类型为1)
- 5 -> 2 (关系类型为1)
- 6 -> 3 (关系类型为2)
- 7 -> 4 (关系类型为2)
- 8 -> 5 (关系类型为2)
- 9 -> 6 (关系类型为3)
上述代码定义了一个图结构,其中包含10个节点和10条边。变量含义如下:
edges
: 表示图中10条边的编号,取值为[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]
。edges_src
: 表示每条边的源节点编号,取值为[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]
,与edges
一一对应。edges_dst
: 表示每条边的目标节点编号,取值为[1, 2, 3, 0, 4, 5, 6, 7, 8, 9]
,与edges
一一对应。rel_type
: 表示每条边的关系类型,取值为[0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 3]
,与edges
一一对应。graph
: 表示由节点和边构成的图结构,它是一个元组,包含了两个张量edges_src
和edges_dst
。
最后这段代码实现了以下功能:
# 创建模型 in_feats = 3 hid_feats = 4 out_feats = 2 rel_num = 4 model = RGCN(in_feats, hid_feats, out_feats, rel_num) # 随机生成特征 features = torch.randn((10, 3)) # 计算输出 output = model(g, features, rel_type) print(output)
- 创建一个RGCN模型对象
model
,该模型具有in_feats
个输入特征、hid_feats
个隐藏特征、out_feats
个输出特征和rel_num
种不同的关系类型。 - 使用
torch.randn
随机生成一个 $10 \times 3$ 大小的特征矩阵features
。 - 将特征矩阵
features
、关系类型张量rel_type
和转换后的DGL图g
作为输入,通过model
模型计算输出特征矩阵output
。 - 输出
output
。
输出
tensor([[ 0.5757, -0.0934], [ 0.9615, 1.4563], [-3.5925, -0.7869], [ 1.2882, -0.3457], [ 2.5402, -0.2980], [ 0.1554, 0.6599], [ 3.8173, 2.2265], [ 0.8300, 1.1929], [ 2.6410, 3.7959], [-1.5862, -0.5873]], grad_fn=<AddBackward0>)