阿里云实时计算Flink部署运行pyflink脚本

本文涉及的产品
实时计算 Flink 版,5000CU*H 3个月
简介: 最近有个需求需要使用py模型输出数据,本地已完成测试,需要完成在实时计算Flink上完成部署及运行

1.概述

需求:读取Kafka数据源,引入py模型,输出预测结果

实时计算Flink环境:已预装了Python 3.7.9,预装Pandas、NumPy、PyArrow等常用的Python库

脚本:

1.pyPredict.py:读取Kafka,写入Kafka

2.xg-model.pkl:xgboost模型,输入特征因子,输出结果

思路:将模型文件以pandas udf形式进行调用

2.部署过程

2.1上传依赖及脚本

1.在资源上传界面点击上传资源将pyPredict.py和xg-model.pkl上传上去

image.png

2.因要读取kafka,需要kafka-connect依赖,在maven上下载flink-connector-kafka依赖jar包flink-connector-kafka_2.12-1.13.6.jar

https://repo.maven.apache.org/maven2/org/apache/flink/

2.2创建作业

1.将依赖及作业填入下方,提交作业点击运行

image.png

2.在作业启动日志里出现错误:ERROR org.apache.flink.client.python.PythonDriver     [] - Run python process failed

java.lang.RuntimeException:Python process exits with code:1

3.怀疑是使用了错误版本的jar包,后来注意到阿里云FLink有使用限制:仅支持开源Scala V2.11版本,如果Python作业中依赖第三方JAR包,请确保使用Scala V2.11对应的JAR包依赖

4.将jar包换成flink-connector-kafka_2.11-1.13.6.jar版本,运行作业后又分别出现如下错误:ModuleNotFoundError:No module named 'joblib';ModuleNotFoundError:No module named 'xgboost';ModuleNotFoundError:No module named 'scipy';

上述报错应该是模型文件xg-model里需要的,参考阿里云文档

image.png

将对应的model包下载下来并上传至资源列表中scipy-1.1.1-cp37-cp37m-manylinux1_x86_64.whl;xgboost-1.6.2-py3-none-manylinux2014_x86_64.whl;joblib-1.2.0-py3-none-any.whl;

image.png

5.将上述作业提交运行之后报:ImportError:cannot import name '_ccallback_c' from 'scipy._lib'经过各种尝试解决问题都不行还是报这个错误,参考StackOverFlow上的建议也是没解决https://stackoverflow.com/questions/64658954/importerror-cannot-import-name-ccallback-c-from-scipy-lib

后咨询一位阿里大佬,让我用如下方式编译包进行使用

image.png

https://help.aliyun.com/document_detail/207351.html

6.参考阿里的文档在一台装有docker的服务器上(仅需docker就行,不需要服务器有py)

a.编译第三方Python包。

 i.在本地准备requirements.txt文件,其内容如下。

scipy
joblib
xgboost

       ii.在本地准备build.sh脚本,其内容如下。

#!/bin/bash
set -e -x
yum install -y zip
PYBIN=/opt/python/cp37-cp37m/bin
"${PYBIN}/pip" install --target __pypackages__ -r requirements.txt
cd __pypackages__ && zip -r deps.zip . && mv deps.zip ../ && cd ..
rm -rf __pypackages__

iii.执行如下命令。

docker run -it --rm -v $PWD:/build  -w /build quay.io/pypa/manylinux2014_x86_64 /bin/bash build.sh

该命令执行完后,会生成一个名字为deps.zip的文件,该文件为编译之后的第三方Python包。

image.png

b.将deps.zip打包上传至资源列表,资源过大则采用OSS上传

7.重新运行作业日志中又出现如下错误:AttributeError:'super' object has no attribute 'get_params'。经与大佬沟通怀疑是py版本兼容问题,接下来采用自定义Python虚拟环境把py版本换成3.8版本,因为模型文件xg-model.pkl是3.8版本生成的

2.3自定义虚拟Python环境

自定义Python虚拟环境需要使用vvr-6.x版本引擎,目前实时计算Flink最高版本引擎为vvr-6.0.2-flink-1.15

  1. 准备Python 3.8的虚拟环境。
  1. 在本地准备setup-pyflink-virtual-env.sh脚本,其内容如下。
set -e
# 下载Python 3.8 miniconda.sh脚本。
wget "https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-py38_4.12.0-Linux-x86_64.sh" -O "miniconda.sh"
# 为Python 3.8 miniconda.sh脚本添加执行权限。
chmod +x miniconda.sh
# 创建Python的虚拟环境。
./miniconda.sh -b -p venv
# 激活Conda Python虚拟环境。
source venv/bin/activate ""
# 安装PyFlink依赖。须使用1.15版本的flink
# update the PyFlink version if needed
pip install "apache-flink==1.15.2"
# 安装模型文件依赖保持与本地环境版本一致
pip install "scipy==1.6.2"
pip install "joblib==1.0.1"
pip install "xgboost==1.6.1"
# 关闭Conda Python虚拟环境。
conda deactivate
# 删除缓存的包。
rm -rf venv/pkgs
# 将准备好的Conda Python虚拟环境打包。
zip -r venv.zip venv

  b. 在本地准备build.sh脚本,其内容如下。

#!/bin/bash
set -e -x
yum install -y zip wget
cd /root/
bash /build/setup-pyflink-virtual-env.sh
mv venv.zip /build/

 c. 在命令行,执行如下命令,完成python 3.8虚拟环境的安装。

docker run -it --rm -v $PWD:/build  -w /build quay.io/pypa/manylinux2014_x86_64 ./build.sh

执行完该命令后,会生成一个名字为venv.zip的文件,即为Python 3.8的虚拟环境。

image.png

2.在Python作业中使用Python 3.8虚拟环境。

a.将venv.zip文件上传至资源列表,文件过大采用OSS上传,因虚拟环境已经将模型文件所需的包打进去,这里只需要venv.zip文件即可;因使用flink1.15版本,则需要1.15版本的kafka-connector包flink-sql-connector-kafka-1.15.2.jar(1.15去scala化了,没有2.11的后缀了)

jar下载路径https://nightlies.apache.org/flink/flink-docs-release-1.15/docs/connectors/table/kafka/

lQLPJxbUFuHUnArNAqDNBjCw5TIHfEwuiQUDXI206sDsAA_1584_672.png

image.png

b.单击右侧的高级配置,在更多Flink配置项,添加配置信息

python.executable: venv.zip/venv/bin/python
python.client.executable: venv.zip/venv/bin/python

image.png

3.运行作业,运行日志出现:java.lang.NoSuchMethodError:org.apache.flink.metrics.groups.SinkWriterMetricGroup.GetNumBytesSendCounter()Lorg/apache/flink/metrics/Counter;

经咨询阿里kakfa大佬,这是一个已知问题。用vvr内部的kafka可以先解决。社区的得到1.15.3才能解决;

4.vvr内部可以直接这么用:

image.png

image.png

在右侧高级配置里添加

pipeline.classpaths: 'file:///flink/usrlib/ververica-connector-kafka-1.15-vvr-6.0.2-3-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar;file:///flink/usrlib/ververica-connector-common-1.15-vvr-6.0.2-3-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar'

或者代码里添加

table_env.get_config().get_configuration().set_string("pipeline.classpaths", "file:///flink/usrlib/ververica-connector-kafka-1.15-vvr-6.0.2-3-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar;file:///flink/usrlib/ververica-connector-common-1.15-vvr-6.0.2-3-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar") 

5.重新运行作业出现AttributeError:'super' object has no attribute 'get_params'错误,和上面直接使用阿里云环境出现同样的问题。现在可以排除是Py版本的问题了,查看报错原因,是因为缺少cikit-learn包

https://stackoverflow.com/questions/68433215/attributeerror-super-object-has-no-attribute-get-params-while-deploying

在上述setup-pyflink-virtual-env.sh脚本中添加,重新打包

pip install "scikit-learn"

6.重新运行,作业正常启动,也有结果输出

2.4使用阿里云环境直接运行

1.参考2.2中编译Python包,在requirements.txt文件中添加scikit-learn,重新打包

2.使用vvr-6.x引擎直接运行,发现作业正常,有数据输出

image.png

3.总结

部署py作业实属不易,期间出现很多问题,也走了不少弯路,前前后后折腾了3天,才把问题解决,期间还得多谢阿里大佬的支持

打铁还需自身硬啊,兄弟们,得多多学习啦

这期就到这里了,拜了个拜

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