Eric 阿里云容器服务资深架构师,金融行业企业解决方案专家,专注于基于Kubernetes的金融行业方案,数据服务,机器学习深度学习,和生物计算方案。负责过多个容器平台,机器学习平台在金融行业,生物计算行业实施落地的。
通过调用AGS的远程任务,可以完成一序列的基因数据的二级分析,不需要申请和持有云计算资源,就可以完成对海量数据的批量处理,目前可以支持人类全基因组,外显子,基因比对,宏基因组比对,Somatic胚系变异发现等业务场景的加速和低成本处理。 通过AGS调用mutect2任务来检测体细胞短突变, 短突变包括单核苷酸(SNV)以及插入和缺失(Indel)的改变。本文介绍如何通过AGS分析肿瘤样本。
新型冠状病毒SARS-CoV-2 RNA在发病后数周内在上呼吸道或下呼吸道中检测到,用于泛病原体检测的基因组下一代测序(mNGS)为此次新冠病毒SARS-CoV-2 RNA 的早期发现和准确测序立下了汗马功劳。 阿里云基因计算服务AGS提供了针对mNGS宏基因组测序数据的快速比对能力,只需要一个阿里云的对象存储Bucket和AGS命令行工具,对一组肺泡采样测序的宏基因组数据3.2Gbase(22M reads),60秒内可以完成和已知的病原体基因组包括新型冠状病毒SARS-CoV-2和39种BetaCov RNA的参考序列的比对,并且支持自定义的病毒库的上传和比对。
阿里云携手华大基因推出极速、低成本、高精度的个人全基因组测序(WGS, Whole Genome Sequencing)云交付方案,只需要15分钟即可完成一个30X WGS的基因比对、排序、去重、变异检测全流程,相比经典流程可达120倍加速,比目前全球最快的FPGA/GPU方案仍能提速2-4倍。
使用API/CLI对阿里云子账户做ACK(Kubernetes) RBAC授权, 实现自动化运维和统一授权管理。系统管理员可以通过脚本,API实现对子账户的RAM,以及Kubernetes RBAC授权。
本文是2018年大数据峰会上的一些分享,关于在线业务,离线业务在ACK(阿里云容器服务Kubernetes)的平台上通过对bandwidth, disk quota的灵活组合完成在线,离线业务场景的混合部署,来提高总体资源的使用率,以及带宽,本地盘资源的动态分配调整,来控制离线,在线资源水位。
本文是2018年大数据峰会上的一些分享,关于在线业务,离线业务在ACK(阿里云容器服务Kubernetes)的平台上通过对namespace, cgroup, quota的灵活组合完成在线,离线业务场景的混合部署,来提高总体资源的使用率,以及支资源限制动态分配调整,来伸缩离线部分的资源水位。
通过阿里云Kubernetes容器服务,开启你的数据服务之旅 (一)云上运维自建数据库之痛,使用容器服务自动恢复数据库postgresql实例 概述 本文为大家介绍一种容器化的数据服务 posgresql db on ACK,通过使用云盘自动挂载实现的块存储PVC来做到数据库的免运维恢复。