请看下列问题

根据你的描述，可能存在以下几个问题：

1、CDH5和CDH6的Phoenix版本不兼容。在迁移HBase表和Phoenix表时，需要注意两个集群中使用的Phoenix版本是否兼容。如果不兼容，可能会导致数据格式不兼容或者数据丢失等问题。

2、主键查询失败。如果以主键为查询条件不能正常过滤出想要的信息，可能是因为主键的值发生了变化或者数据格式不兼容。可以尝试重新创建Phoenix表或者使用Phoenix的命令行工具进行主键查询，查看是否能够正常查询。

3、联合主键查询失败。如果联合主键对应的字段不能正常使用，可能是因为在CDH6中Phoenix的配置或者版本不兼容。可以检查Phoenix的配置文件和日志，查看是否有相关的报错信息，并尝试重新创建Phoenix表或者使用Phoenix的命令行工具进行联合主键查询。

4、Snapshot恢复失败。如果在CDH6中使用Snapshot方式跨集群迁移数据时出现问题，可能是因为CDH5和CDH6的HBase版本不兼容，或者在Snapshot恢复过程中发生了数据格式转换错误。可以检查CDH6的HBase和Phoenix的配置文件和日志，查看是否有相关的报错信息，并尝试重新创建Snapshot并进行恢复。

总的来说，迁移HBase表和Phoenix表需要注意版本兼容性，同时需要进行详细的测试和评估，确保数据的完整性和一致性。如果尝试以上还是不能解决问题，可以参考相关的文档和社区论坛，或者咨询技术支持人员进行解决。