MySQL压测时Linux中断异常飚高,原来是因为...

本文涉及的产品
RDS MySQL DuckDB 分析主实例,集群系列 4核8GB
简介: MySQL压测时Linux中断异常飚高,原来是因为...

1. 系统环境

  • OS: CentOS Linux release 7.8.2003 (Core)
  • Kernel: 3.10.0-1127.19.1.el7.x86_64
  • MySQL: 用5.0、5.7均有此问题,应该和版本无关

2. 压测工具

  • benchyou[1]
  • mysql_random_load[2]

3. 问题现象

利用 mysql_random_load 工具连接MySQL写入数据时,性能非常非常低。

由于 mysql_random_load 工具不支持通过socket连接,只好放弃,改用benchyou。顺便说一下,benchyousysbench极为相似,也非常好用。

改用benchyou工具后,压测正常。看来的确不是MySQL版本的问题。

mysql_random_load 工具进行压测时,系统负载非常高,同时可观测到系统的中断也很高并且也很不均衡。

[root@yejr.run]# vmstat -S m 1
procs -----------memory---------- ---swap-- -----io---- -system-- ------cpu-----
 r  b   swpd   free   buff  cache   si   so    bi    bo   in   cs us sy id wa st
 2  0      0  73585      2  41051    0    0   117    91    4    2  0  0 99  0  0
 2  0      0  73585      2  41051    0    0     0 28320 55444 100207 18  2 80  0  0
 4  0      0  73584      2  41052    0    0     0  1936 52949 98607 18  2 81  0  0
 2  0      0  73583      2  41052    0    0     0  4864 56375 101262 14  2 84  0  0
 4  0      0  73583      2  41052    0    0     0 29064 55806 103715 19  2 80  0  0
 5  0      0  73583      2  41052    0    0     0  5704 55854 98386 15  2 83  0  0

可以看到 system.in 这列的值非常高,改成benchyou工具后,这列的值从5.5万降到1.6万。

[root@yejr.run]# vmstat -S m 1

procs -----------memory---------- ---swap-- -----io---- -system-- ------cpu-----
r b swpd free buff cache si so bi bo in cs us sy id wa st
4 0 0 77238 2 38371 0 0 118 88 2 3 0 0 99 0 0
2 0 0 77234 2 38374 0 0 0 31620 16039 77988 3 2 95 0 0
2 0 0 77231 2 38377 0 0 0 31996 16091 78926 3 2 95 0 0
3 0 0 77229 2 38378 0 0 0 33028 16347 81006 3 2 95 0 0
0 0 0 77226 2 38383 0 0 0 52412 15496 75715 3 2 95 0 0
2 0 0 77224 2 38384 0 0 0 32252 16167 79352 3 2 95 0 0

再看下有问题时的系统中断表现

[root@yejr.run]# mpstat -I SUM -P ALL 1
Linux 3.10.0-1127.19.1.el7.x86_64 (yejr.run) 09/28/2020 x86_64 (32 CPU)

05:37:40 PM CPU intr/s
05:37:41 PM all 51833.00
05:37:41 PM 0 2069.00
05:37:41 PM 1 1159.00
05:37:41 PM 2 2979.00
05:37:41 PM 3 1580.00
05:37:41 PM 4 1627.00
05:37:41 PM 5 1461.00
05:37:41 PM 6 1243.00
05:37:41 PM 7 1825.00
05:37:41 PM 8 2154.00
05:37:41 PM 9 1367.00
05:37:41 PM 10 1277.00
05:37:41 PM 11 1376.00
05:37:41 PM 12 4085.00
05:37:41 PM 13 1601.00
05:37:41 PM 14 4045.00
05:37:41 PM 15 1857.00
05:37:41 PM 16 1692.00
05:37:41 PM 17 722.00
05:37:41 PM 18 118.00
05:37:41 PM 19 1862.00
05:37:41 PM 20 1637.00
05:37:41 PM 21 1130.00
05:37:41 PM 22 1750.00
05:37:41 PM 23 1653.00
05:37:41 PM 24 1417.00
05:37:41 PM 25 1547.00
05:37:41 PM 26 1500.00
05:37:41 PM 27 1033.00
05:37:41 PM 28 20.00
05:37:41 PM 29 1683.00
05:37:41 PM 30 888.00
05:37:41 PM 31 1549.00

可以看到每秒中断总量有5.5万,但多个CPU间并不均衡。

4. 问题分析

初步认定是因为系统中断太高导致的写入性能差,并且也认定是因为多个CPU间中断不均衡导致的这个问题。

观察是都有哪些中断比较高,发现主要是 LOC 和 RES 这两个每秒的增长比较大。

[root@yejr.run]# watch -d cat /proc/interrupts
...
LOC: 2468939840 2374791518 2373834803 2373613050 Local timer interrupts
SPU: 0 0 0 0 Spurious interrupts
PMI: 0 0 0 0 Performance monitoring interrupts
IWI: 50073298 45861632 45568755 45833911 IRQ work interrupts
RTR: 0 0 0 0 APIC ICR read retries
RES: 3472920231 3022439316 2990464825 3012790828 Rescheduling interrupts
CAL: 5131479 6539715 17285454 11211131 Function call interrupts
TLB: 23094853 24045725 24230472 24271286 TLB shootdowns
TRM: 0 0 0 0 Thermal event interrupts
...

在尝试修改相关中断号绑定的CPU后(参考:SMP affinity and proper interrupt handling in Linux[3]),问题还是没有得到缓解。

后来某神秘大佬给指点了下,才发现原来是个内核的bug,涉及到参数 kernel.timer_migration,需要将其设置为 0 才行。

[root@yejr.run]# sysctl -w kernel.timer_migration=0

当然了,最好持久化写入到 /etc/sysctl.conf 文件中。

[root@yejr.run]# cat /etc/sysctl.conf

kernel.timer_migration=0

#加载配置文件使之生效
[root@yejr.run]# sysctl -p

再次用 mysql_random_load 工具进行压测就没事了。

下面是关于该bug的描述

The bug is when linux os receive too many tcp packages, 
and the tcp may add too many timer, but in
get_target_base->get_nohz_timer_target it check current
cpu is idle, sometimes thouth the current core is very busy,
but the idle_cpu result is 1, in this time
if set kernel.timer_migration=1 ,the timer will be move to next cpu.

bug详情见:Bug 124661 - kernel.timer_migration=1 cause too many Rescheduling interrupts[4]

最后,值得一提的是,在云主机上修改该参数应该是不管用,除非修改物理机的。我在某云主机上运行 mysql_random_load 工具压测也遇到类似问题,修改内核参数后问题依旧。

文内链接

全文完。

Enjoy Linux & MySQL :)

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