InnoDB：
是MySQL默认的事务型存储引擎，只有当需要它不支持的特性时，才会考虑使用其它的存储引擎。 实现了四个标准的隔离级别，其中默认为可重复读，在可重复读的隔离级别下，通过MVCC（多版本并发控制协议）+ 间隙锁（Next-key Locking）防止幻读。 主索引为聚簇索引，在索引中保存数据，从而避免直接读取磁盘，因此对查询性能有很大的提升。 支持真正的在线热备份。其它存储引擎不支持在线热备份。 支持行级锁，通过给索引项加锁来实现，即只有通过索引条件检索数据，才会使用行级锁，否则使用表锁。 InnoDB不会对表中行的总量进行预先统计，每次count需要遍历计算。
MyISAM：
设计简单，数据以紧密格式存储。对于只读数据，或者表比较小、可以容忍修复操作，则依然可以使用它。 提供了大量的特性，包括压缩表、空间数据索引等。 不支持事务。 不支持行级锁，只能对整张表加锁，读取时会对需要读到的所有表加共享锁，写入时则对表加排它锁。 会实时保存数据库表中的总行数，计算快。
总结：
事务：MyISAM不支持，InnoDB支持。 锁级别： MyISAM 表级锁，InnoDB 行级锁及外键约束。 MyISAM存储表的总行数；InnoDB不存储总行数。 MyISAM采用非聚集索引，B+树叶子存储指向数据文件的指针。InnoDB主键索引采用聚集索引，B+树叶子存储数据。 崩溃恢复: MyISAM 崩溃后发生损坏的概率比 InnoDB 高很多，而且恢复的速度也更慢。
使用场景：
MyISAM适合：插入不频繁，查询非常频繁，如果执行大量的SELECT，MyISAM是更好的选择，没有事务。 InnoDB适合：可靠性要求比较高，或者要求事务； 表更新和查询都相当的频繁， 大量的INSERT或UPDATE。
