新智元新智元 2022-07-29 12:33 发表于北京
新智元报道
编辑：拉燕 Aeneas 如願 桃子
【新智元导读】今天，AlphaFold又让学术界沸腾了。DeepMind官宣，AlphaFold可以预测出2亿多个蛋白质结构，几乎覆盖了整个「蛋白质宇宙」。
今天，DeepMind再次引爆学术界！
AlphaFold能够预测2亿多个蛋白质结构，实现数量级的重大飞跃。
最重要的是，全部免费开放！
在未来，预测蛋白质结构就如同使用「谷歌搜索引擎」一样简单。
DeepMind的首席执行官Demis Hassabis称，
「这个数据库涵盖了整个蛋白质宇宙，我们已经迈入数字生物学的全新时代！」
超2亿蛋白质结构，免费用
不可小觑的是，AlphaFold确实是学术界「海啸级」的存在，足以改变全人类。
2021年，DeepMind开源AlphaFold2后，震撼发布了AlphaFold蛋白质结构数据库(AlphaFold DB) 。
当时，98.5%的人类蛋白质结构全被AlphaFold2预测出来了。
而现在，DeepMind正式宣布该数据库已经从近100万扩大到2.14亿个结构，预测蛋白质结构数量也提升了200多倍！
几乎涵盖了地球上所有已进行过基因组测序的生物体。
据介绍，在超过2亿个蛋白质结构预测中，大约35%的结构具有高精度，并且已达到了实验手段获取的结构精度。
80%的结构可靠性足以用于多项后续分析。
让人兴奋的是，所有蛋白质三维结构都可以通过谷歌云公共数据集 (Google Cloud Public Datasets) 进行批量下载。
（https://github.com/deepmind/alphafold/blob/main/afdb/README.md）
这次数据库的更新更是涵盖了植物、细菌、动物和其他微生物的蛋白质结构。
另外，DeepMind也将自身数据库集成到其他公共数据集，像Ensembl、UniProt 和 OpenTargets都可以使用。
目前，AlphaFold已被广泛使用，成为了世界各地成千上万实验室和大学的重要工具。
仅发布12个月后，已经有190个国家/地区的50多万研究人员访问数据库AlphaFold DB，查看了超200万个结构。
科学家用其推进现实问题的研究，诸如疟疾候选疫苗、蜜蜂健康、抗生素抗药性等等。
当前公布的这份前所未有的2亿多个蛋白质结构，将帮助我们探索生命科学的无尽奥秘。
AlphaFold的成功逆袭之路
时至今日，一提到AlphaFold，仍旧让人兴奋不已。
因为它的诞生成功破解了生物学持续50年的重大难题——蛋白质折叠问题。
还证明了AI可以在几分钟内以原子精度准确预测蛋白质的形状！
说起AlphaFold的发展历程，其实算得上有些年头了。
很多人可能都不知道，2016年可以说是DeepMind开发AlphaFold萌芽的起点。
2016：潜力无限
2016年，DeepMind的AlphaGo刷爆网络。
来自韩国的世界知名棋手李世石不敌AlphaGo，让人们见识到了AI能做什么。
人们也开始逐渐意识到，AI真的潜力无穷。除了围棋，在未来还能应用在各种各样的科学研究中。
也是从这时开始，DeepMind想尝试用AI解决蛋白质的折叠问题。
很快，AlphaGo吸粉无数的那一年3月，DeepMind组建了一队人马，开始着手研究蛋白质结构的预测问题。
2018：初次亮相
2年后，也就是2018年，生物学界的「AlphaGo」来了。
AlphaFold在国际蛋白质结构预测竞赛（CASP）上首次亮相，力压其他97个参赛者。
当时，AlphaFold预测出了43种蛋白质中25种蛋白质的最精确结构。
在同一类别中排名第二的队伍，只预测出了3种。
一时间，所有人将其为DeepMind在科学发现领域的第一个重要里程碑。
